Velikost: Třída CLK je luxusní kupé střední velikosti, zatímco třída CLS je luxusní sedan v plné velikosti. Třída CLS je ve všech rozměrech větší než třída CLK a nabízí více vnitřního prostoru a nákladového prostoru.
Design: Třída CLK má tradičnější tvar kupé s dlouhou kapotou, krátkým kufrem a strmě zkoseným čelním sklem. Třída CLS má výraznější design s linií střechy fastback a agresivnější přední maskou.
Výkon: Třída CLK a třída CLS jsou k dispozici s řadou motorů, od čtyřválcových přeplňovaných jednotek až po výkonné motory V8. Třída CLS však obvykle nabízí výkonnější motory než třída CLK.
Funkce: Třída CLK a třída CLS jsou standardně dodávány s řadou luxusních prvků, jako jsou kožená sedadla, panoramatické střešní okno a automatická klimatizace. Třída CLS však obvykle nabízí pokročilejší funkce, jako je head-up displej, prostorová kamera a vyhřívaný volant.
Cena: Třída CLK je obvykle levnější než třída CLS. Je to dáno tím, že třída CLS je větší a luxusnější vozidlo.
Celkově jsou CLK-Class a CLS-Class dvě odlišné modelové řady Mercedes-Benz, které nabízejí různé kombinace velikosti, designu, výkonu, funkcí a ceny. Kupující, kteří hledají luxusní kupé střední velikosti, by měli zvážit třídu CLK, zatímco kupující, kteří hledají luxusní sedan v plné velikosti, by měli zvážit třídu CLS.