Některé verze motoru D16 jsou vybaveny VTEC (Variable Valve Timing and Lift Electronic Control), což je technologie, která mění časování a zdvih ventilů motoru pro zlepšení výkonu a spotřeby paliva.
Motor D16 s VTEC je typicky označován jako motor D16Z6. Poprvé byl představen v roce 1989 v modelech Honda Civic Si a CRX Si. Motor D16Z6 produkuje 125 koní a 106 liber-stop točivého momentu.
Motor D16Z6 je známý pro svůj hladký průběh výkonu, vysokootáčkový charakter a vynikající spotřebu paliva. Je považován za jeden z nejlepších čtyřválcových motorů, které kdy Honda vyrobila.