Vodík je plyn, který není snadno dostupný v čisté formě. Obvykle se nachází ve sloučeninách, jako je voda (H2O) nebo uhlovodíky (jako je metan, CH4). Aby bylo možné použít vodík jako palivo, musí být oddělen od těchto sloučenin, což vyžaduje energii. Tento proces může být drahý a časově náročný, což je jeden z důvodů, proč auta s palivovými články nejsou tak běžná jako auta na benzín.
