* Infrastruktura: Je třeba vybudovat masivní síť vodíkových čerpacích stanic. Jde o nesmírně nákladný podnik, který dalece přesahuje současnou investici. Stávající infrastruktura čerpacích stanic se vyvíjela desítky let.
* Výrobní náklady: Výroba zeleného vodíku (vodík vyrobený z obnovitelných zdrojů energie) je v současnosti nákladná. Zatímco náklady klesají, musí výrazně klesnout, aby vodíková auta byla konkurenceschopná s EV.
* Náklady na vozidlo: Vozidla s vodíkovými palivovými články jsou složitá a nákladná na výrobu. Náklady na samotné palivové články jsou hlavním faktorem.
* Energetická účinnost: Proces výroby, přepravy a používání vodíku je méně energeticky účinný než přímé používání elektřiny v bateriových elektrických vozidlech (BEV).
Zatímco některé modely vodíkových automobilů jsou již k dispozici (ačkoli velmi omezené a drahé), nezbytná infrastruktura a snížení nákladů pro široké přijetí je ještě mnoho let daleko. Bateriová elektrická vozidla v současnosti dosahují mnohem rychlejšího pokroku díky již existující elektrické infrastruktuře a rychle klesajícím nákladům na baterie. Je pravděpodobnější, že BEV budou v dohledné době na trhu dominovat a možná ponechají okrajovou roli pro vodíková vozidla ve specifických aplikacích, jako je těžká nákladní doprava, kde technologie baterií čelí větším výzvám.